Главным героем увлекательного фильма "Лохматый спецназ" является обычный двенадцатилетний мальчишка по имени Оуэн Бейкер. Он мечтает о лучшем друге. В его жизни всегда не хватало настоящего, верного товарища, который всегда был бы рядом. Его родители, долго отказывавшие сыну в просьбе завести собаку, наконец уступают, и Оуэн с восторгом приносит домой лохматого щенка, которому дает имя Хаббл. На первый взгляд, это самая обычная дворняжка, однако вскоре мальчику предстоит узнать, что его новый питомец — далеко не тот, кем кажется на первый взгляд. Однажды утром Оуэн просыпается от странного звука. Он не сразу понимает, что произошло, но вскоре осознаёт, что он понимает речь своей собаки. Первое, что слышит Оуэн от Хаббла, — тревожная и загадочная фраза: «Отведи меня к вашим вожакам». Мальчик в шоке, но это лишь начало открытия, которое перевернёт его представление о мире. Хаббл (или, как выясняется, Кэнид 3942) — вовсе не обычная собака. Он является специальным агентом, посланным с далёкой звезды Сириус по приказу Великой Догини, правительницы древней цивилизации собак.
Миссия Хаббла — проверить, как обстоят дела с главной задачей, поставленной перед его народом тысячелетия назад. Ведь, согласно приказу, собаки были отправлены на Землю не просто так. Они должны были стать высшими существами, правителями планеты, установить свою мудрую власть над людьми. Однако реальность оказывается далека от запланированного. Вместо того чтобы повелевать людьми, собаки превратились в их преданных спутников, домашних любимцев, которых балуют, гладят и водят на прогулки. Это ошеломляет Хаббла: «Вы должны были править! А вместо этого… вы — просто домашние животные!». Теперь у него нет выбора — он должен доложить Великой Догине о полном провале миссии. А последствия могут быть катастрофическими: если собаки не выполнили своё предназначение, их могут навсегда отозвать с Земли! Понимая, что судьба всех собак висит на волоске, Оуэн и его новый друг оказываются перед невозможной задачей, подготовить собак к проверке, убедив Великую Догиню в том, что они по-прежнему главенствуют на планете. Объединившись с разношерстной компанией местных собак, ленивым бульдогом, вечно взволнованным терьером, напыщенным пуделем и мудрым старым овчаркой, они начинают подготовку.
