Главный герой анимэ сериала «Сто девушек, которые очень-очень-очень-очень-очень сильно тебя любят» обычный школьник Рэнтаро Аидзё. Он привлекателен, спортивен и популярен среди сверстников, но эти качества, к сожалению, не приносят ему успеха в личной жизни. Несмотря на все свои усилия, каждый раз, когда он признаётся девушке в своих чувствах, его ждёт отказ. И вот, в день окончания средней школы, судьба подкидывает ему очередной удар, сотый по счету отказ. Это становится для главного героя последней каплей. В отчаянии он отправляется в старинный храм сватовства, надеясь, что сверхъестественные силы смогут помочь ему изменить его невезучую судьбу. В сердцах он просит о том, чтобы в старших классах наконец-то найти свою любовь. В этот момент перед ним появляется Бог святилища, который с улыбкой предсказывает, что в старших классах девушки просто не дадут ему прохода. Однако Бог не уточняет, какой будет цена такой удачи.
После каникул предсказание начинает сбываться. В первый же день учёбы Рэнтаро сталкивается с тем, что по необъяснимой причине, практически все девушки в школе влюбляются в него до безумия. Каждая из них — личность с уникальным характером, интересами и способностями, и каждая готова бороться за его внимание. Ситуация быстро выходит из-под контроля, когда количество девушек, стремящихся завоевать его сердце, продолжает расти. Рэнтаро пытается разобраться в своих чувствах и найти способ справиться с этой волной любви. Его задача становится ещё сложнее, когда он узнаёт, что отвергнуть хоть одну из девушек означает разрушить не только предсказание, но и их искренние чувства. Это может иметь неожиданные последствия. Теперь ему предстоит найти баланс между уважением к чувствам каждой девушки и своим собственным счастьем.